物語の舞台は、全部が“しかくい”世界に浮かぶカクコロ島。主人公の目的は、この島に眠るといわれるすごいおたからを探すこと。“しかくい”ポケモン＝「ポクセル」たちといっしょに、おたから目指して探検に挑もう！

この世界では、ポケモンたちももちろん“しかくい”姿。おなじみの『ポケットモンスター 赤・緑』のポケモンたちが登場するよ。またポケモン図鑑にも、“しかくい”ポケモンがずらり！