リーダー・アオギリが率いる組織。アオギリの下には、幹部のウシオ、イズミ。その下に、したっぱの団員たちが複数存在する。
彼らは地上に大雨を降らし、海を増やすことを目的に活動している。
アクア団のリーダー アオギリ
「ポケモンにとっての理想郷を築く」という目的を追い求める、まっすぐな気持ちを持つアクア団のリーダー。
豪快な性格で、部下たちからの信頼も厚い。理想の追求のためなら、自分自身やアクア団がどうなってもかまわないと考える、危険な人物でもある。
不思議な石「キーストーン」がついた「メガイカリ」
アオギリはメガシンカの使い手で、ポケモンのメガシンカに必要となる不思議な石「キーストーン」がついた「メガイカリ」を身につけているぞ!
アオギリのポケモン サメハダー
凶暴でずる賢い、海のギャング。
鉄をも噛み砕くキバを持ち、大型タンカーも1匹でバラバラにする。
最高速度は時速120キロを超える。
アクア団の幹部 イズミ
アクア団の頭脳と言える存在。
見た目も人あたりも基本的に厳しいが、その知性と、裏表のない態度、行動力から、男女問わず団内にファンが多いようだ。
アクア団の幹部 ウシオ
レスラーのような大きな体と、強い精神力を持つ。
過去にアオギリに助けられた恩があり、命の恩人としてのアオギリを心から慕っている。アオギリの理想を自らの理想として、それを実現するためならば、命を投げ出してもかまわないと思っている。