木々が生い茂るジャングルや広大な砂漠など、それぞれ環境が異なる島々が点在している「レンティル地方」。手つかずの自然が残されており、そこに暮らすポケモンの生態や自然環境については、調査がほとんど行われていない。主人公はカガミ博士からの依頼で、大自然に溢れる島々を訪れ、いきいきとした野生のポケモンを写真に撮って、生態を調査していくことになるぞ! ポケモンたちの野生ならではの表情やしぐさを発見しながら、自分だけのポケモンフォト図鑑を作りあげていこう。
ポケモン調査の体験会へ参加するために、レンティル地方を訪れた主人公。
そこでレンティル地方の調査をしているカガミ博士の依頼により、大自然に溢れる島々を訪れ、その島々に生息する野生のポケモンの生態を調査することになるぞ。調査中は、ポッド型の乗り物「ネオワン号」がルートに沿って自動で移動するので、周囲を見渡しながらたくさん写真を撮影しよう! 撮影した写真をカガミ博士に見せることで、調査は進んでいくぞ。調査を進めると、新たな島にも訪れることができるようだ。
野生のポケモンを撮影して、レンティル地方に暮らすポケモンの生態を調査していく。主人公の見た目は、物語の始めに選ぶことができるぞ。
「レンティル ポケモン自然科学研究所」で、ポケモンやレンティル地方の自然環境について研究しているカガミ博士。その研究を手伝っているリタは、主人公に島のことや調査のことを教えてくれるぞ。
とある人物といっしょにレンティル地方を訪れ、主人公といっしょに調査隊に参加する。主人公をライバル視しており、何かと突っかかってくることも。