在「地下大洞窟」裡使用道具「挖洞鑽」，就能在牆壁中建造出「秘密基地」。你可以在「秘密基地」內自由地擺設在挖掘化石時挖到的「寶可夢的石像」，並隨個人喜好布置。
在「秘密基地」內擺設「寶可夢的石像」的話，聚集到寶可夢秘巢的寶可夢似乎會有所變化。此外，也有一部分「寶可夢的石像」是用不同於一般的材料製成，因而特別珍貴。所以多多挖掘化石來收集石像吧！