シンオウ地方に伝わる神話に登場する3匹の伝説のポケモン。シンオウ地方の人々からは、「ユクシー」は知識の神、「エムリット」は感情の神、「アグノム」は意思の神と呼ばれている。この3匹のポケモンは、主人公の冒険とどのように関わってくるのだろうか。