ポケモンたちは、おなじみの『10まんボルト』や『はかいこうせん』など、さまざまなわざを使ってバトルをする。さらに、本作では、仲間全員が敵を囲い込んでわざを使う、「レンケイ」という機能もあるよ! レンケイを行うと、本来不利なタイプ相性でも、相性を無視して“ゴリおし”で攻撃することができる! 困難な状況も、一気に切り抜けよう!
冒険に役立つ効果をもつ、新しい道具「リングル」と「ラピス」が登場。リングルはポケモンにもたせる道具で、このリングルにラピスをはめることによって効果を発揮するよ!
ラピスは、ダンジョンの中でのみ手に入り、ダンジョンから出るとなくなってしまう。ラピスの中には、ダンジョンの攻略に大きく役立つ強力なものもあり、難易度の高いダンジョンでは、闇雲に先を目指すだけでなく、時にはラピスでポケモンを強化しながら先に進むといった、プレイヤーの戦略性が試される。
ダンジョンの中である条件を満たすと、ポケモンが「覚醒」するよ。覚醒中のポケモンは、大幅にパワーアップした状態になる。また、ポケモンによっては、このとき「メガシンカ」して姿やタイプ・とくせいが変わり、パワーアップするよ。メガシンカしたポケモンは、たくさんの相手を一度に攻撃できるほか、壁を壊すこともできる!